章节大纲
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生物化学精品共享课程于2016年由广东工业大学立项为校级精品课程建设项目,经过两年的建设后于2018年申报广东省生物化学共享精品课程并获批准立项建设。参加该课程建设的课题组成员有谭竹钧教授、赵宏霞副教授(博士)、傅明辉教授(博士)、韩雅莉教授(博士)、张宏梅教授(博士)、王华倩副教授(博士)、廖问陶讲师(博士)和黄明星实验师(博士)。
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教学内容:
1、 宇宙与人影视:宇宙、恒星、 太阳系、地球的起源;生命的起源与演化。
2、 生物化学的概念和研究的内容;
3、 生物化学的发展简史及现状;
4、 生物化学与其它学科的关系;
5、 各个典型代表人物在科学发展中的作用。
6、 生物化学的应用。
7、 例举生物化学发展几个时期的应用。
重点掌握内容:
生物化学的发展简史和现状;生物化学与各学科的关系及其在国民经济中的意义。
本章教学要点:
要求学生了解生物化学的主要内容、研究方法;生物化学的发展简史和现状;生物化学与各学科的关系及其在国民经济中的意义。
本章学习内容包括:1、生物化学的定义、生物化学的起源、发展与趋势。2、生物化学发展的几个阶段、就的生物化学的突破与新的生物化学的出现;3、生物化学研究的主要内容。现代生物化学的发展导致一门新的学科兴起----产生了分子生物学;4、生物化学的任务:理论上探讨生命的本质和生命的起源;生产实践上具有广阔的广泛应用前景。本章学习掌握的内容包括:对于生物化学的绪论学习,系统了解生物化学的发展历史和现状,以及生物化学与分子生物学的关系。了解生物化学是一门生命科学的专业基础课。生物化学课程是本科生物工程专业、生物制药专业、食品科学与工程专业、环境生态学专业、农学、生物医药学材料专业等各个相关本科专业的极为重要的专业基础课。
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1、糖类的存在与来源、糖类的化学组成与元素构成、糖类的生物学功能;2、单糖的结构、单糖的物理和化学性质、重要的单糖及单糖的衍生物;3、寡糖、寡糖的结构与性质、常见的寡糖。4、多糖的概念,同多糖与杂多糖、杂多糖的代表--细菌杂多糖的结构。5、糖蛋白和糖链的概念。
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本章要求掌握的知识点内容包括:
掌握糖类的元素构成、糖类的命名;单糖、寡糖、多糖的结构、物理和化学性质、构象等概念,糖类的功能。明确糖类物质在生命活动中的作用以及应用在发酵工业中的地位和作用。1、什么是糖类,它的基本元素和化学组成是如何;糖类物质的基本生物学功能有哪些?;2、什么是单糖,单糖的结构、物理和重要的化学性质有哪些?掌握重要的单糖及单糖的衍生物的基本特性;3、掌握寡糖、寡糖的结构与性质以及常见的寡糖类型。4、掌握多糖的概念,同多糖与杂多糖、杂多糖的代表--细菌杂多糖的结构。5、糖蛋白和糖链的概念。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在单糖的结构和化学性质,醛、酮糖参加的反应,单糖的结构,讲清楚直链和环形结构;注意区别寡糖和多糖的特点。多糖中同质多糖和异质多糖概念。
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本章学习内容包括:1,脂质的定义、脂质的元素构成、脂质的分类,命名、脂质的生物学功能。2、脂肪酸、脂肪酸的种类、脂肪酸的物理和化学性质、多价不饱和脂肪酸。3、三酰甘油酯和蜡。4、磷脂、糖脂、固醇酯以及脂蛋白。5、脂类物质的分离、提取与分析技术。
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要求熟练掌握脂肪的结构、性质和功能,初步掌握类脂的结构、性质和功能。了解脂类物质在生命活动中的作用。掌握磷脂和固醇类脂质的结构性质和特点以及在生物体内的功能。了解其他脂质的种类,结构和功能等。1,什么是生物脂质、生物脂质是由那些元素构成的、生物脂质的种类以及如何命名的、各种不同的脂质具有何种生物学功能。2、脂肪酸、天然脂肪酸的种类及分子结构特点、脂肪酸的物理和化学性质、多价不饱和脂肪酸。3、三酰甘油酯的结构、磷脂、糖脂、固醇酯以及脂蛋白的分子结构及性质。4、脂类物质的分离、提取与分析技术方法。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在脂类和类脂的结构和化学性质,讲清楚两者的不同的化学性质和相同的地方;讲清楚各种脂质的化学结构、脂肪、甘油三酯、磷脂、固醇酯、萜和蜡在结构上和性质上的区别。
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本章学习的内容包括四个小节:第一节 氨基酸: 1、氨基酸的分类、氨基酸的酸碱性质与解离、氨基酸的化学性质与理化性质。3、氨基酸混合物的分析分离方法。第二节 蛋白质的共价结构:1、蛋白质通论;2、肽和肽链结构;3、蛋白质的一级结构;4、蛋白质一级结构与生物学功能。第三节 蛋白质的三维结构:1、维持蛋白质三维结构的力;2、蛋白质的二级结构、超二级结构、结构域以及三级结构。3、蛋白质的四级结构。第四节 蛋白质的分离纯化 :1、蛋白质的酸碱性质;2、蛋白质的分子大小与形状;3、蛋白质的胶体性质与蛋白质的沉淀;4、蛋白质分离纯化的一般原则;5、蛋白质分离纯化的方法以及纯度测定。
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蛋白质是生命现象的物质基础。要求熟练掌握蛋白质的概念,蛋白质的概念及重要性、蛋白质的组成、蛋白质分类;蛋白质在生命活动中所起的重要作用; 蛋白质的构件分子--氨基酸包括:氨基酸的结构、氨基酸的分类、氨基酸的理化性质等。
氨基酸一节教学要点以及难点:
本节要点和难点在1、氨基酸的结构和理化性质,氨基酸是两性电解质、等电点的概念和求法;氨基酸的化学和物理性质,20种蛋白质氨基酸和105种非蛋白质氨基酸的概念,。
多肽类一节教学目的和要求以及难点:
本章要求学生掌握肽键和肽键的概念,蛋白质的一级结构结构的概念和以及结构的测定;蛋白质的分子空间结构;包括二级结构、三级结构和四级结构的概念;蛋白质和氨基酸的组成成分、分类及分离提纯。
本节要点和难点在肽链和肽键的性质和结构蛋白质的组织结构层次,二级结构的类型,构型和构象的概念,超二级结构、结构域的概念;三级结构的球形分子构成的主要力是非共价键等。四级结构主要是多亚基构成等。蛋白质结构与功能的关系。
蛋白质一节重点掌握内容以及难点:
本节要求学生掌握蛋白质的理化性质概念;蛋白质是由氨基酸组成,因此具有两性电解质的性质和等电点的概念,蛋白质分子量的大小,以及测定分子量的方法,蛋白质的胶体性质以及破坏了胶体性质后蛋白质出现的沉淀反应等。在强烈的环境条件下蛋白质的变性作用。鉴别蛋白质的方法,颜色反应等。
本节要点和难点在蛋白质的胶体性质以及蛋白质分离纯化的方法和原理,主要有蛋白质形成胶体的条件以及破坏胶体性质后会出现的现象等是该堂课 的主要解决的问题。
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本章学习内容分为三节:第一节: 酶通论;1、酶催化作用的特点;酶与催化剂的比较、酶作为生物催化剂的特点;2、酶的化学本质及其组成;3、酶的命名与分类。4、酶催化反应的专一性;5、酶活力的测定及酶的分离纯化。第二节:酶促反应动力学,1、化学动力学概念;2、底物对酶反应速率的影响;3、酶的抑制作用;4、温度、pH对酶反应的影响;5、激活剂对酶反应的影响。第三节:酶的作用机理,1、酶的活性部位;2、酶催化的高效性研究;3、酶活性的调节控制。
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教学目的和要求以及重点掌握内容:
本堂课要求学生掌握一、酶的催化作用与分子活化能;二、中间络活物;三、诱导契合学说;四、酶促反应速度,以及酶促动力学米曼氏方程的推导米、曼常数的意义、竞争性抑制以及动力学;二、酶浓度;三、底物浓度;四、温度;五、PH值;六、测定酶的活力单位、比活力;七、酶的制备和应用。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在酶催化的特异性、相对特异性、绝对特异性、立体结构特异性,第二个难点为酶促反应动力学及其影响因素, 酶促动力学米曼氏方程的推导米、曼常数的意义、竞争性抑制以及动力学都好似较难掌握的内容,作教材后面的作业题力,求让学生掌握本章的难点。
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本章主要的学习的内容为三节内容:第一节:核酸的结构;1、核苷酸;2、核酸的共价结构;3、DNA的高级结构;4、RNA的高级结构;第二节:核酸的物化性质;1、核酸的水解;2、核酸的酸碱性质;3、核酸的紫外吸收性质;4、核酸的变性、复性及分子杂交。
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教学目的和要求以及重点掌握内容:
本堂课要求学生掌握核酸是生物遗传信息储存、传递的主要物质。要求掌握核酸的组成、结构及主要理化性质;了解核酸结构与性质之间的关系,核酸的变性与复性,分子杂交等概念核酸的分离纯化。
除构成核酸外。核苷酸还可以构成生物活性物质,如能量分子、细胞信号分子和其他衍生物等
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在核酸的UV吸收性质以及变性与复兴核算的分子杂交以及如何分离纯化核酸的方法和原理,PCR的原理是该堂课的主要解决的问题。
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本章学习的主要内容有三节:第一节,维生素与辅酶1、维生素概论;2、脂溶性维生素;3、水溶性维生素;4、作为辅酶的金属离子。第二节,激素,1、激素的概述;2、激素的合成与分泌;3、重要的激素以及激素的调节控制。第三节,抗生素种类以及结构,1、抗生素的概论;2、重要的抗生素化学和医学治疗原理;3、抗肿瘤抗生素;4、抗生素在农业中的应用。(重点学习是维生素与辅酶,其他两节由学生自学为主)
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维生素在生物体内的作用不同于糖类 脂肪和蛋白质,它不是作为碳原、氮源或能源物质,不是用来供能或构成生物体回阻成部分,但却是代谢过程中所必需的。 已知绝大多数维生素作为酶的辅酶或辅基的组成成分,在物质代谢中起重要作用。当 机体缺乏维生素时,物质代谢发生障碍。因为各种维生素的生理功能不同, 缺乏不同的维生素产生不同的症状。
本章学习重点内容包括:一、维生素的概念,二、脂溶性维生素种类、分子结构、在生物体内所起到的生物学功能。三、水溶性维生素的种类、分子的基本结构、水溶性维生素主要是以酶的辅助因子协同酶的催化作用。重要的水溶性维生素包括它们的基本结构以及在体内的活性形式:如NAD、NADP、FAD、FMN、磷酸吡哆醛、COA-SH、FH4等的重要作用;四、金属酶与金属激活酶类的概念等。
要求学生掌握一、两大类维生素的性质、作用和生物学意义;维生素与辅酶和辅基的关系;二、脂溶性维生素有VA、VD、VE、VK他们的生物学意义的作用;三、水溶性维生素,B族 维生素一般在体内都是 作为酶蛋白分子的 辅酶;四、某些维生素素的发现历史。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在水溶性维生素在体内的生物学作用主要是辅酶和辅基,水溶性维生素的结构分子大小都不相同,起的作用也完全不同,做教材后面的作业题力,求让学生掌握本章的难点。
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生命之所以能够存在的主要原因就是生命体能够和他的外部环境进行物质和能量交换,如果这种运动停止了,那么生命就停止了,随之生命体就解体了。这个交换的过程就是--新陈代谢。
代谢总论要讲三个内容:第一节、新陈代谢;1、合成代谢、2、分解代谢;3、能量在代谢中的传递作用。第二节,生物能学;1、热力学的几个关键概念;2、高能磷酸化合物;第三节,生物氧化:1、生物氧化;2、氧化一还原电势;3、电子传递和氧化呼吸链;4、氧化磷酸化作用。
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在本章要求学习和掌握的内容包括:第一部分:1、分解代谢与合成代谢; 2、能量代谢在新陈代谢中的重要地位; 3、辅酶Ⅰ和辅酶Ⅱ的递能作用; 4、FMN和FAD的递能作用; 5、辅酶A在能量代谢中的作用; 6、新陈代谢的调节。第二部分:1、体系的概念、性质和状态; 2、能的两种形式——热与功;3、内能和焓的概念;4、热力学第一定律 ;5、化学能的转化;6、热力学第二定律和熵的概念;7、自由能的概念。第三部分:1、生物氧化;2、氧化一还原电势;3、电子传递和氧化呼吸链;4、氧化磷酸化作用及其机理。
要求学生掌握生物能学的基本概念、活化能的概念;1、辅酶Ⅰ和辅酶Ⅱ的递能作用;2、FMN和FAD的递能作用;3、辅酶A在能量代谢中的作用;4、ATP的递能作用。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在生物中的能学;活化能的概念,ATP的特殊地位以及他的作用,在讲清楚生物氧化、呼吸链的概念、呼吸链的组成和类型、氧化磷酸化与ATP 的生成的偶联关系。
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本次教学内容:
第一节 糖的酶促水解与转运;第二节 糖的分解代谢
一、糖的无氧代谢
教学目的和要求以及重点掌握内容:
糖类是生物体的主要能源、碳源和重要组成物质,对生命活动有非常重要的作用。本堂课要求学生掌握要求掌握多糖的酶促水解、低聚糖的酶促水解 ;无氧酵解过程,无氧酵解过程涉及到的酶类,限速酶和限速步骤;无氧酵解的抑制作用以及每一步所需反应的酶类
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点在无氧酵解过程及涉及的酶类,一分子葡萄糖分解为2分子的三碳糖,然后进一步氧化生成丙酮酸,讲清楚限速酶和限速步骤最为关键。
二、糖的有氧代谢
三、磷酸戊糖循环
教学目的和要求以及重点掌握内容:
本堂课要求学生掌握糖的有氧氧化过程及糖原的异生作用;1、丙酮酸进入TCA前转化为乙酰辅酶A的过程,机理;所涉及的酶类。2、TCA循环的每一步所涉及的酶类,每一步反应的原理,反应方程式;3、TCA过程中的抑制作用,4、产生的NADH、FAD以及ATP;4能量计算;5、与呼吸链的关系,6、TCA的双重代谢作用,TCA的生理学意义等;
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本章教学内容:
第一节 脂类的酶促水解;一、脂肪的酶促水解;二、类脂的酶促水解
第二节 脂肪的分解代谢;一、甘油的氧化;二、脂肪酸的β-氧化;三、脂肪酸氧化过程中的能量转化
第三节 脂肪的合成代谢;一、α-磷酸甘油的生物合成;二、脂肪酸的生物合成;三、脂肪的合成
第四节 磷脂、胆固醇的代谢;一、磷脂的代谢;二、胆固醇的代谢
教学目的和要求以及重点掌握内容:
脂类是生物体的贮存能源主要形式和重要组成物质也是构成神经、生物膜等必不可少的成分,对生命活动有非常重要的作用。本堂课要求学生掌握要求掌握脂肪酸的β-氧化过程和在胞浆中合成脂肪酸的过程;了解脂类的酶促水解、磷脂和胆固醇的代谢。
掌握重点内容:一、肪酸的β-氧化 二、脂肪酸氧化过程中的能量转化 。
本章教学要点以及难点:
本章要点和难点为脂肪酸的β-氧化、脂肪酸氧化过程中的能量转化脂肪酸氧化分为5个步骤(1)活化(2)氧化(3)水化(4)再氧化(5)硫解。脂肪酸在开始氧化时需要活化,以后的循环只是重复后4步骤。他们的其他代谢途径的关联讲清楚最为关键。
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本次教学内容:第一节 蛋白质的酶促水解;第二节 氨基酸的分解代谢;一、脱氨基作用;二、脱羧基作用
教学目的和要求以及重点掌握内容:
蛋白质是生命活动最重要的大分子之一,在生命活动中离不开蛋白质。蛋白质及氨基酸在生物体内不断地进行自我更新的。要求掌握氨基酸的脱氨基作用、氨基酸的合成作用及氨基酸分解产物的代谢转变;了解蛋白质的酶促水解、氨基酸的脱羧基作用。
本章教学要点以及难点:
掌握重点内容:第一节 蛋白质的酶促水解 第二节 氨基酸的分解代谢一、脱氨基作用二、脱羧基作用 。
本章难点:脱氨基作用、转氨作用以及氨的去路等,脱去氨基后的碳骨架去路问题以及氨基酸分解产物的代谢最为关键。
第三节 氨基酸分解产物的代谢;(一)氨基酸的转氨基作用;(二)氧化脱氨基作用:谷氨酸脱氢酶;(三)其他的脱氨基作用;(四)联合脱氨基作用;(五)氨基酸的脱羧基作用;(六)氨的命运。
教学目的和要求以及重点掌握内容:
1、一般转氨酶催化都需a-酮戊二酸作为受氨体,所以对a-酮戊二酸或谷氨酸有要求,对其它氨基酸无严格专一性。2、转氨酶对多种氨基酸都有转氨作用,但速度快慢不同,催化最快的就是它的天然底物。3、转氨一般是可逆的,平衡常数接近1.0。4、有些氨基酸不能转氨有些非蛋白质氨基酸也能转氨。如鸟氨酸。5、体内重要的转氨酶有谷丙转氨酶和谷草转氨酶。6、联合脱氨作用;7、尿素循环8、碳骨架的去路。
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本次教学内容包括:
核酸的基本结构单位是核苷酸。细胞内存在多种游离的核苷酸,它们几乎参与细胞的所有生化过程。
①核苷酸是核酸生物合成的前体。
②核苷酸衍生物是许多生物合成的活性中间物。例如,UDP一葡萄糖和CDP一二脂酸甘油分别是糖原和磷酸甘油酯合成的中间物。
③ATP是生物能量代谢中通用的高能化合物。
④腺苷酸是三种重要辅酶(烟酰胺核苷酸、黄素腺嘌呤二核苷酸和辅酶A)的组分。
⑤某些核苷酸是代谢的调节物质。如cAMP P和cGMP是许多种激素引起的胞内信使;(P)ppGpp是氨基酸饥饿引起效应的中间介质;腺苷酰基、尿苷酰基是酶活性共价修饰基团。
教学目的和要求以及重点掌握内容:
核酸的降解;(一)核酸的解聚作用;(二)核苷酸的降解;(三)嘌呤碱的分解;(四)嘧啶碱的分解。
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本章教学要点以及难点:
第一条途径:各种碱基可以与R-1-P反应,生成核苷;再由核苷磷酸化酶催化生成核苷酸。
a)碱基+R-1-P----核苷+Pi
b)核苷+ATP-----核苷酸+ADP
载体内置发现腺苷酸磷酸激酶其他嘌呤核苷酸激酶没有发现。
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本章教学内容包括:第一节 DNA的半保留复制;第二节 DNA复制的起点和方式;第三节 DNA聚合反应有关的酶;第四节 DNA的半不连续复制;第五节 DNA复制的拓扑性质;第六节 DNA复制的过程;第七节 真核生物DNA的复制;
教学目的和要求以及重点掌握内容:DNA复制是生命遗传的主要内容要掌握DNA复制的原理,复制方法以及复制的过程等内容:
1、复制起始点的识别:复制有特点起始点,富含AT已被引发蛋白结合和解链。
2、DNA的解旋与解链:经拓朴异构酶及解旋酶作用解旋、解链,SSB 结合,形成复制叉结构。
3、RNA引物形成:在DNA指导RNA聚合酶作用下合成一小段RNA引物。
4、DNA在引物上的延长:由5-3‘方向连续合成先导连,,与复制叉相反的是后随链,首先在引物上合成冈崎片段,然后由DNA聚合酶1切去引物,氨碱基配对原则补齐引物空缺。
5、DNA片段的连接;在连接酶作用下形成完整DNA。
6、复制终止:识别终止区,复制体解体,复制两链在拓扑异构酶作用下分开。完成复制。
本章教学要点以及难点:
重点讲清楚DNA的合成、DNA的半保留复制、DNA的不连续复制过程。复制的各种不同的方式;所涉及到的酶类。掌握半保留复制半不连续复制以及他们在概念上的区别;掌握DNA指导的DNA聚合酶以及作用方式。
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本次教学内容包括:第一节 DNA指导下RNA的合成;第二节 RNA的转录后加工;第三节 在RNA指导下RNA和DNA的合成
教学目的和要求以及重点掌握内容:
(一)DNA指导的RNA聚合酶;
(二)转录过程
(三)转录的调节控制
(四) RNA生物合成的抑制剂
本章教学要点以及难点:转录以及RNA指导下的RNA的合成(RNA复制)等问题。
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本次教学内容主要包括:第一节 遗传密码的破译;第二节 遗传密码的基本特性;第三节 蛋白质合成的分子基础;第四节 翻译的步骤;第五节 蛋白质的运输及翻译后修饰。
教学目的和要求以及重点掌握内容:
生物体内由酶催化氨基